Protein Secondary Sequence

ccPDB - Dataset for prediction protein secondary structure

@kaggle.tamzidhasan_protein_secondary_sequence

Table List

2 tables(10.2 MB)

Pdb 31–07–2011

Pdb 31–12–2012

Pdb 31–12–2012

@kaggle.tamzidhasan_protein_secondary_sequence.pdb_31_12_2012

2.37 MB
5877 rows
5 columns

unnamed_0 Unnamed: 0	pdb_id Pdb Id	seq Seq	sst3 Sst3	sst8 Sst8
	1a0gA	GYTLWNDQIVKDEEVKIDKEDRGYQFGDGVYEVVKVYNGEMFTVNEHIDRLYASAEKIRITIPYTKDKFHQLLHELVEKNELNTGHIYFQVTRGTSPRAHQFPENTVKPVIIGYTKENPRPLENLEKGVKATFVEDIRWLRCDIKSLNLLGAVLAKQEAHEKGCYEAILHRNNTVTEGSSSNVFGIKDGILYTHPANNMIAKGITRDVVIACANEINMPVKEIPFTTHEALKMDELFVTSTTSEITPVIEIDGKLIRDGKVGEWTRKLQKQFETKIPKPL	CEEEECCEEEEHHHCCECCCEHHHHHCCEEEEEEEEECCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCCCCECCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEEEEECCCEEEEEECCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCEHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC	CEEEETTEEEEGGGCCBCTTBHHHHHCCEEEEEEEEETTEETTHHHHHHHHHHHHHHTTCCCSSCHHHHHHHHHHHHHHHTCSSEEEEEEEECCBCSSCSSCCCTTSCCEEEEEEEECCCCHHHHHHCEEEEEEECCCCSCTTSCBSCCHHHHHHHHHHHHTTCSEEEEEETTEEEEESSSEEEEEETTEEECCCSSTTSCCCHHHHHHHHHHHHTTCCEECCCCBHHHHTTCSEEEEEETTTEEEEEEEETTEESTTSSCCHHHHHHHHHHHTTSCCCC
1	1a27A	ARTVVLITGCSSGIGLHLAVRLASDPSQSFKVYATLRDLKTQGRLWEAARALACPPGSLETLQLDVRDSKSVAAARERVTEGRVDVLVCNAGLGLLGPLEALGEDAVASVLDVNVVGTVRMLQAFLPDMKRRGSGRVLVTGSVGGLMGLPFNDVYCASKFALEGLCESLAVLLLPFGVHLSLIECGPVHTAFMEKVLGSPEEVLDRTDIHTFHRFYQYLAHSKQVFREAAQNPEEVAEVFLTALRAPKPTLRYFTTERFLPLLRMRLDDPSGSNYVTAMHREVFG	CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEECCECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC	CCEEEEESCCSSHHHHHHHHHHHTCTTCCEEEEEEESSGGGTHHHHHHHHHTTCCTTSEEEEECCTTCHHHHHHHHHTCTTSCCSEEEECCCCCCCSCGGGCCHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEEEGGGTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTEEEEEEEECCBSSSTTTTSCCCHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCBCHHHHHHHHHHHHHCSSCCSEEESCSTTHHHHHTTTSSTTSHHHHHHHHHHHHC
2	1a34A	TGDNSNVVTMIRAGSYPKVNPTPTWVRAIPFEVSVQSGIAFKVPVGSLFSANFRTDSFTSVTVMSVRAWTQLTPPVNEYSFVRLKPLFKTGDSTEEFEGRASNINTRASVGYRIPTNLRQNTVAADNVCEVRSNCRQVALVISCCFN	CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCEEEEHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEECCHHHCCCECCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEC	CCCSCCSCCCCCCCSCCCCCSSCCEEEEEEEEEECCTTCCEEEEGGGGCCGGGTCTTCSCEEEEEEEEEECSCCSTTCCCEEEEEECCTTCCCCCCEEEECSSTTSCCEEEEECCGGGCCCBCTTSEEEEEEESSSEEEEEEEEEEC
3	1a3aA	LFKLGAENIFLGRKAATKEEAIRFAGEQLVKGGYVEPEYVQAMLDREKLTPTYLGESIAVPHGTVEAKDRVLKTGVVFCQYPEGVRFGEEEDDIARLVIGIAARNNEHIQVITSLTNALDDESVIERLAHTTSVDEVLELLAGRK	CCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCECCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCEECCECCHHHHHHECCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCC	CCCCCGGGEECSCCCSSHHHHHHHHHHHHHHTTSBCTHHHHHHHHHHHHSCCEEETTEECCBCCGGGGGGBSSCEEEEEEEEEEEECSSSTTCEEEEEEEEECSTTTHHHHHHHHHHHTCSHHHHHHHHHCCCHHHHHHHTTTCC
4	1a3cA	QKAVILDEQAIRRALTRIAHEMIERNKCILVGIKTRGIYLAKRLAERIEQIEGNPVTVGEIDITLYRNDEPLVKGADIPVDITDQKVILVDDVLYTGRTVRAGMDALVDVGRPSSIQLAVLVDRGHRELPIRADYIGKNIPTSKSEKVMVQLDEVDQNDLVAIYEN	CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHCCCEEEEECC	CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECSSCCTTSEEEEEEEEESSSHHHHHHHHHHHHHCCCSEEEEEEEEECCCCSSSCCCSEEEEECCCCSSCEEEEECHHHHSSCEEEEECC
5	1a3zA	TWKEATLPQVKAMLEKDDGKVSGDTVTYSGKTVHVVAAAVLPGFPFPSFEVHDKKNPTLEIPAGATVDVTFINTNKGFGHSFDITKKGPPYAVMPVIDPIVAGTGFSPVPKDGKFGYTDFTWHPTAGTYYYVCQIPGHAATGMFGKIVVK	CCEEECHHHHHHHHCCCCCEEECCEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEECCEECCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCECCEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHCCEEEEEEC	CCEEECHHHHHHHHTTCCCEEETTEEECCSSEEEEEEEESCTTSCSSCEEETTEESCEEEECTTCEEEEEEEECCTTCCCCCEEESCCSCCCSSCCCCSCSEECCCCCCCBTTBEEEEEEEECCCSEEEEEECCSTTTGGGTCEEEEEEC
6	1a40A	EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYWYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSV…	CCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEECHHHHHHHHHCCCCECCCHHHHHHCCCCCCCCCECEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHCCCCEECEEECCCCCEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCECCCCCCCCCEEEEEEEEEECEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCEECCHHH…	CCEEEEEECSTTHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHTTSSSEEEESSCCCHHHHHHHTEEEEEEEEEEEEEEECCTTCCTTTCEECHHHHHHHHHTCCCBTTCHHHHHHSTTCCCCCCBCEEEEESSCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHTCCSSSCCCSSCEEESHHHHHHHHHHHSTTEEEEEEHHHHHTTTCEECEEECTTSCEECCCHHHHHHHTTTCCTTTCSCCCCBSCCSTTCCSBEEEEEEEEESEESSHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHTTCEECCHHH…
7	1a48A	SITKTELDGILPLVARGKVRDIYEVDAGTLLFVATDRISAYDVIMENSIPEKGILLTKLSEFWFKFLSNDVRNHLVDIAPGKTIFDYLPAKLSEPKYKTQLEDRSLLVHKHKLIPLEVIVRGYITGSAWKEYVKTGTVHGLKQPQGLKESQEFPEPIFTPSTDENISPAQAAELVGEDLSRRVAELAVKLYSKCKDYAKEKGIIIADTKFEFGIDEKTNEIILVDEVLTPDSSRFWNGASYKVGESQDSYDKQFLRDWLTANKLNGVNGVKMPQDIVDRTRAKYIEAYETLTGSKWSH	CCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEECCEEEEEECCCCEECCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECECCCCCCCCHHHHCCHHHHCHHHHHHHCCCEEEEECCEECCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCEECCEECCCCCCCCCEEEEEEECCECCCECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECEEEECCCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC	CCSSCCCTTSSCEEEECSSEEEEEEETTEEEEEECSCCEETTEECSSCCTTHHHHHHHHHHHHHHHTTTTCEECBCCCCTTCCGGGGSCGGGGSHHHHHHHTTSEEEEECCEECCSBEEEEEECCHHHHHHHHHHSEETTEECCSCCCTTCEEEEEEECCBCCCBCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTEEEEEEEECEEEETTTTEEEECSCCSCTTTEEEEESTTCCTTSCCCCTTTHHHHHHHHHTTCTTCSSCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
8	1a62A	XNLTELKNTPVSELITLGENXGLENLARXRKQDIIFAILKQHAKSGEDIFGDGVLEILQDGFGFLRSADSSYLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDTISGKIRPPKEGERYFALLKVNEVNFDKPE	CEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEECHHHCCCCCCCCEEECHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCECCC	CBHHHHHTSCHHHHHHHHHTTTCCCCTTSCHHHHHHHHHHHHHHTTCCEEEEEEEEECTTSCEEEECGGGTTCCCTTCEEECHHHHHHTTCCTTCEEEEEEECCCTTCCSEEEEEEEEETTBCCC
9	1a73A	ALTNAQILAVIDSWEETVGQFPVITHHVPLGGGLQGTLHCYEIPLAAPYGVGFAKNGPTRWQYKRTINQVVHRWGSHTVPFLLEPDNINGKTCTASHLCHNTRCHNPLHLCWESLDDNKGRNWCPGPNGGCVHAVVCLRQGPLYGPGATVAGPQQRGSHFVV	CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCEEEEEEEECCEEEEEECCCHHHCCCCCEECCEEEEEEECCCCCCECCHHHEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCECCCCCCCCCCC	CCCHHHHHHHHHHHHHHHTTSCEEEEEEEEETTEEEEEEEEBCCSSSCCSTTEEEEETTEEEEEEEETTEEEEEETTTGGGTTSCSEETTEEEEEEETTCCTTBCCGGGEEEEEHHHHHHGGGCCCTTTTCCCSSCCSSCCTTCSSCCCSBCSCCSSSSCCC


CREATE TABLE pdb_31_12_2012 (
  "unnamed_0" BIGINT,
  "pdb_id" VARCHAR,
  "seq" VARCHAR,
  "sst3" VARCHAR,
  "sst8" VARCHAR
);