Protein Secondary Sequence

ccPDB - Dataset for prediction protein secondary structure

@kaggle.tamzidhasan_protein_secondary_sequence

Table List

2 tables(10.2 MB)

Pdb 31–07–2011

Pdb 31–12–2012

Pdb 31–07–2011

@kaggle.tamzidhasan_protein_secondary_sequence.pdb_31_07_2011

7.84 MB
17608 rows
5 columns

unnamed_0 Unnamed: 0	pdb_id Pdb Id	seq Seq	sst3 Sst3	sst8 Sst8
	12asA	AYIAKQRQISFVKSHFSRQLEERLGLIEVQAPILSRVGDGTQDNLSGAEKAVQVKVKALPDAQFEVVHSLAKWKRQTLGQHDFSAGEGLYTHMKALRPDEDRLSPLHSVYVDQWDWERVMGDGERQFSTLKSTVEAIWAGIKATEAAVSEEFGLAPFLPDQIHFVHSQELLSRYPDLDAKGRERAIAKDLGAVFLVGIGGKLSDGHRHDVRAPDYDDWSTPSELGHAGLNGDILVWNPVLEDAFELSSMGIRVDADTLKHQLALTGDEDRLELEWHQALLRGEMPQTIGGGIGQSRLTML…	CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCECCCCECCCCCECCEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHH…	CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCSEEETTSSCSCCTTTTCCCCEECCSSSTTCCEEECSCCTTHHHHHHHHTTCCTTCEEEEEEEEECTTCSCCCSSCCSEEEEEEEEEECCTTCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCCCCSCSSCEEEEHHHHHHHSSSSCHHHHHHHHHHHHSEEEEECCSSCCSSSCCSSCCCTTTBCCSSBCTTSSBCSEEEEEEEETTTTEEEEEEEEEEBCCHHHHHHHHHHHTCTTGGGSHHHHHHHTTCSCCEEEEEEEHHHHHHH…
1	16vpA	SRMPSPPMPVPPAALFNRLLDDLGFSAGPALCTMLDTWNEDLFSALPTNADLYRECKFLSTLPSDVVEWGDAYVPERTQIDIRAHGDVAFPTLPATRDGLGLYYEALSRFFHAELRAREESYRTVLANFCSALYRYLRASVRQLHRQAHMRGRDRDLGEMLRATIADRYYRETARLARVLFLHLYLFLTREILWAAYAEQMMRPDLFDCLCCDLESWRQLAGLFQPFMFVNGALTVRGVPIEARRLRELNHIREHLNLPLVRSAATEEPGAPLTTPPTLHGNQARASGYFMVLIRAKLDS…	CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCECCCEEEECCEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC…	CCSCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHTCTTHHHHHHHHHHCCCCCSTTSCCCGGGGTTCGGGCSCHHHHHHHHHHCCCCCSSCCTTCCCSSCCCCCCSSGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCCHHHHHHHHIIIIIHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHTTEEEEESCSHHHHSSCCSCSBCCSEEEETTEECCHHHHHHHHHHHHHTTCCCCBCTTTSCTTSCSCCCCCCCTTSCCHHHHHHHHHHHHHTS…
2	1914A	MVLLESEQFLTELTRLFQKCRSSGSVFITLKKYDEGLEPAENKCLLRATDGKRKISTVVSSKEVNKFQMAYSNLLRANMDGLKKRAQGGEQKLFQTWEEFSRAAEKLYLADPMKVRVVLKYRHVDGNLCIKVTDDLVCLVYRTDQAQDVKKIEKFHSQLMRLMVAKESRNV	CCEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCECCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEECEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC	CCEECHHHHHHHHHHHHHHTSSSCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEESSSCEEEEEEETTSHHHHHHHHHHHHHHHSCCSBCCCCEEEEECCCSHHHHHHHHHHHHHHCTTTCEEEEEEETTTTEEEEEEECSSSEEEEEECBGGGHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
3	1a0iA	VNIKTNPFKAVSFVESAIKKALDNAGYLIAEIKYDGVRGNICVDNTANSYWLSRVSKTIPALEHLNGFDVRWKRLLNDDRCFYKDGFMLDGELMVKGVDFNTGSGLLRTKWTDTKNQEFHRKKDKVPFKLHTGHLHIKLYAILPLHIVESGEDCDVMTLLMQEHVKNMLPLLQEYFPEIEWQAAESYEVYDMVELQQLYEQKRAEGHEGLIVKDPMCIYKRGKKSGWWKMKPENEADGIIQGLVWGTKGLANEGKVIGFEVLLESGRLVNATNISRALMDEFTETVKEATLSQWGFFDAC…	CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEEEECCCCCECHHHHHHCEECHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCECCCCCCCCCCCCCECCCCEEEEEEEEEEHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCEECCEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC…	CTTCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHSSEEEEECCCSEEEEEEEETTSEEEEECTTSCBCGGGGGGCEECHHHHHHHHSTTCCCTTEEEEEEEEEESSSCTTTHHHHHHCCSCCSSBSSCCCCCSCCCCCBCTTTEEEEEEEEEEHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCTTSEEEECCEEEESSHHHHHHHHHHHHTTTCCCEEEECTTCEECSEEEEEEEEESCCEEEEEEEEEEECCCTTTSSCSSCCEEEEECTTSCEEEEBCCCSHHHHHHHHHHHHHHTTTSCCCCCC…
4	1a0pA	QDLARIEQFLDALWLEKNLAENTLNAYRRDLSMMVEWLHHRGLTLATAQSDDLQALLAERLSSARLLSAVRRLFQYLYREKFREDDPSAHLKDLSEAQVERLLQAPLIDQPLELRDKAMLEVLYATGLRVSELVGLTMSDISLRQGVVRVIGKGNKERLVPLGEEAVYWLETYLEHGRPWLLNGVSIDVLFPSQRAQQMTRQTFWHRIKHYAVLAGIDSEKLSPHVLRHAFATHLLNHGADLRVVQMLLSDLSTTQIYTHVATERLRQLHQ	CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEHHHEECCCCEEEEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCECCECCCCCECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC	CHHHHHHHHHHHHHHTTCSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCTTTCCHHHHHHHHHSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSSCTTSCCCCCCHHHHHHHHHCSCTTSHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHTTCBGGGEETTTTEEEEECSSSCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHTHHHHHTTCCCCBSSBCTTSSBCCHHHHHHHHHHHHHHTTCCGGGCCHHHHHHHHHHHHHHHCSSCGGGSSCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
5	1a0rP	FEGQASHTGPKGVINDWRKFKLESEFSRKMSVQEYELIHKDKEDENCLRKYRRQCMQDMHQKLSFGPRYGFVYELESGEQFLETIEKEQKITTIVVHIYEDGIKGCDALNSSLICLAAEYPMVKFCKIKASNTGAGDRFSSDVLPTLLVYKGGELLSNFISVTEQLAEEFFTGDVESFLNEYGLLPEK	CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC	CCSSCCSSHHHHHHHHHHHHHHHTCCCCCSCHHHHHHHTTCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCSEEECCSHHHHHHHHHSSCTTCEEEEEEECTTSTTHHHHHHHHHHHHHHCTTSEEEEEEHHHHCCTTSSCTTTCSEEEEEETTEEEEEETTGGGGSCTTCCHHHHHHHHHTTTCSCCC
6	1a12A	KKVKVSHRSHSTEPGLVLTLGQGDVGQLGLGENVMERKKPALVSIPEDVVQAEAGGMHTVCLSKSGQVYSFGCNDEGALGRDTSVEGSEMVPGKVELQEKVVQVSAGDSHTAALTDDGRVFLWGSFRDNNGVIGLLEPMKKSMVPVQVQLDVPVVKVASGNDHLVMLTADGDLYTLGCGEQGQLGRVPELFANRGGRQGLERLLVPKCVMLKSRGSRGHVRFQDAFCGAYFTFAISHEGHVYGFGLSNYHQLGTPGTESCFIPQNLTSFKNSTKSWVGFSGGQHHTVCMDSEGKAYSLGR…	CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHCCEECCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEECEEECCEEEECCEECECEEEEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCEECCCECCCCCCECCEEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEC…	CCCCCCCTTCCCCCBEEEEEEECTTSTTCSCTTCCEEEEEEEECCSSCEEEEEECSSEEEEEETTSCEEEEECCTTSTTCSCCCSTTGGGSCEECCCCSCEEEEEECSSEEEEEETTSCEEEEECEEETTEEEESSBBTBCEEEEEEECCSSCEEEEEECSSEEEEEETTSCEEEEECCTTSTTCSCGGGTSSSCGGGGHHHHHSCEECCCBCSSCCSBCCEEEEEEETTEEEEEETTCCEEEEECCTTSTTSCSSCSCEEEEEECGGGCCTTCCEEEEEECSSEEEEEETTSCEEEEEC…
7	1a17A	PPADGALKRAEELKTQANDYFKAKDYENAIKFYSQAIELNPSNAIYYGNRSLAYLRTECYGYALGDATRAIELDKKYIKGYYRRAASNMALGKFRAALRDYETVVKVKPHDKDAKMKYQECNKIVKQKAFERAIAGDEHKRSVVDSLDIESMTIEDEYS	CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC	CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHSTTCHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHCTTCHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHHHHHHHHSTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCTTCCCCCSCC
8	1a1xA	AGEDVGAPPDHLWVHQEGIYRDEYQRTWVAVVEEETSFLRARVQQIQVPLGDAARPSHLLTSQLPLMWQLYPEERYMDNNSRLWQIQHHLMVRGVQELLLKLLPDD	CCCCCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEECCCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEECCCC	CCCCCCCCCSEEEEEETTEEEETTSCEEEEEEEECSSCEEEEEECCCCCCCSCCCHHHHTTCSSCSEEEEETTTEEEETTSCEEEEEEEEEETTEEEEEEEECCCC
9	1a27A	ARTVVLITGCSSGIGLHLAVRLASDPSQSFKVYATLRDLKTQGRLWEAARALACPPGSLETLQLDVRDSKSVAAARERVTEGRVDVLVCNAGLGLLGPLEALGEDAVASVLDVNVVGTVRMLQAFLPDMKRRGSGRVLVTGSVGGLMGLPFNDVYCASKFALEGLCESLAVLLLPFGVHLSLIECGPVHTAFMEKVLGSPEEVLDRTDIHTFHRFYQYLAHSKQVFREAAQNPEEVAEVFLTALRAPKPTLRYFTTERFLPLLRMRLDDPSGSNYVTAMHREVFG	CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEECCECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC	CCEEEEESCCSSHHHHHHHHHHHTCTTCCEEEEEEESSGGGTHHHHHHHHHTTCCTTSEEEEECCTTCHHHHHHHHHTCTTSCCSEEEECCCCCCCSCGGGCCHHHHHHHIIIIIIHHHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEEEGGGTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTEEEEEEEECCBSSSTTTTSCCCHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCBCHHHHHHHHHHHHHCSSCCSEEESCSTTHHHHHTTTSSTTSHHHHHHHHHHHHC


CREATE TABLE pdb_31_07_2011 (
  "unnamed_0" BIGINT,
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  "sst8" VARCHAR
);